Le fonctionnement s’appuie sur une équipe multidisciplinaire constituée de médecins pédopsychiatres, de psychologues, orthophonistes, psychomotriciens, et d’infirmiers Le rôle du médecin pédopsychiatre est d’examiner les demandes, de réaliser une consultation initiale, de programmer les examens et bilans utiles et d’assurer le rendu des conclusions lors d’une consultation de restitution et par écrit (compte-rendu). Le rôle des psychologues, orthophonistes et psychomotriciens est de réaliser des évaluations dans les différents domaines du développement, tant à but de diagnostic que d’évaluation fonctionnelle et de recherche de comorbidités. L’infirmière reçoit les demandes, les précise et aide à la constitution d’un dossier complet. Elle réoriente les demandes qui ne relèvent pas des missions du centre de diagnostic. Elle coordonne le déroulement du processus diagnostic tout au long de celui-ci et constitue l’interlocutrice privilégiée des familles au cours du diagnostic. En fonctions des besoins et examens déjà réalisés, le centre de diagnostic peut faire appel à des partenaires cliniques pour la recherche de pathologies somatiques associées en particulier grâce au partenariat avec le service de génétique clinique de l’hôpital.